Sal. Cloruro de sodio, pero es más corriente la mezcla de sal para hacer agua sintética.
Salinidad. Medida de la cantidad de sal en el agua. Se expresa en gm/litro. El agua de mar natural tiene una salinidad de aproximadamente 33,7 gm/litro.
Seda (queta). Cerda quitinosa.
Sellador de silicona. Adhesivo utilizado para unir vidrios o parar fugas. Se utiliza para crear formaciones de rocas y corales, cuevas, etc. Se recomienda usarlo en un ambiente bien ventilado, pues desprende un fuerte olor a vinagre. Lo dejaremos secar durante al menos 24 horas. Se debe usar un sellador especifico para acuarios y no del tipo que se vende para uso doméstico.
Sifón. Un trozo de tubo para sacar agua del acuario, también puede referirse a órgano inhalador de los moluscos u otros invertebrados.
Simbiosis. Relación entre dos partes para mutuo provecho, por ejemplo, el pez limpiador y sus «clientes» o, menos estrictamente, los payasos y las anémonas de mar.
Simetría radial. Simetría, en la cual las distintas partes del cuerpo están ordenadas alrededor de un eje central.
Sistema total. Término utilizado para los acuarios con un sofisticado filtrado incorporado y con otros sistemas de dirección que se encargan de un tratamiento completo del agua.
Sustrato. Término alternativo para la cobertura de la base en el acuario.